במערכות על מאגרי מים הפאנלים הסולאריים מותקנים על פלטפורמות צפות (מצופים ייעודיים). בשל כך קיימת מורכות גדולה אשר דורשת מומחיות ייחודית בתחום ושימוש בחומרים ברמה הטובה ביותר אשר עמידים למים ולקורוזיה. כמו כן יש חשיבות מיוחדת בהקפדה על פרטים ותכנון קפדני. לפני כל התקנה נערכת תחילה בדיקה יסודית של התנאים המיוחדים בסביבת המאגר, כולל גודל המאגר, עומקו ויציבותו, תנועת המים והשפעות הסביבה.
למרות האתגרים במערכות אלו יש גם יתרונות רבים כגון הקטנת התאדות והורדת הטמפרטורה במים, מה שמועיל גם בשיפור איכות המים וגם בחסכון במים, במקביל להפקת החשמל הסולארי.
הקמת מתקנים סולאריים על מאגרי מים משלבת ייצור אנרגיה נקייה עם שימור והגנה על משאבי המים. השילוב של קירוב המתקן למקור המים עם הפקת אנרגיה מתחדשת מאפשר ניצול אפקטיבי של השטח המצומצם, מקטין את טביעת הרגל הפחמנית ומקדם את השימוש באנרגיה נקייה לטובת הסביבה והקהילה.
